Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
RAPGEF6Q8TEU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.61■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RAPGEF6Q8TEU7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RAPGEF6Q8TEU7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
RAPGEF6Q8TEU7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RAPGEF6Q8TEU7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RAPGEF6Q8TEU7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
RAPGEF6Q8TEU7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RAPGEF6Q8TEU7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
RAPGEF6Q8TEU7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RAPGEF6Q8TEU7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
RAPGEF6Q8TEU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAPGEF6Q8TEU7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAPGEF6Q8TEU7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF6Q8TEU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF6Q8TEU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAPGEF6Q8TEU7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RAPGEF6Q8TEU7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAPGEF6Q8TEU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF6Q8TEU7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAPGEF6Q8TEU7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAPGEF6Q8TEU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RAPGEF6Q8TEU7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF6Q8TEU7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
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