Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATL2Q8NHH9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL2Q8NHH9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATL2Q8NHH9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATL2Q8NHH9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATL2Q8NHH9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATL2Q8NHH9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATL2Q8NHH9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.4 ms