Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C3Q8NEB9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3C3Q8NEB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3C3Q8NEB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3C3Q8NEB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms