Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE23Q8NDY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHE23Q8NDY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE23Q8NDY6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms