Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C15orf54Q8N8G6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf54Q8N8G6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C15orf54Q8N8G6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C15orf54Q8N8G6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C15orf54Q8N8G6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms