Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC185Q8N715 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC185Q8N715 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC185Q8N715 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC185Q8N715 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC185Q8N715 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC185Q8N715 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms