Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MINDY1Q8N5J2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MINDY1Q8N5J2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MINDY1Q8N5J2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MINDY1Q8N5J2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY1Q8N5J2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MINDY1Q8N5J2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms