Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNKDQ8N490 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNKDQ8N490 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNKDQ8N490 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNKDQ8N490 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNKDQ8N490 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNKDQ8N490 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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