Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC18Q8N456 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC18Q8N456 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC18Q8N456 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC18Q8N456 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LRRC18Q8N456 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms