Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIRREL3Q8IZU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms