Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW03

SIAH3, Seven in absentia homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH3Q8IW03 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIAH3Q8IW03 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIAH3Q8IW03 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIAH3Q8IW03 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIAH3Q8IW03 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIAH3Q8IW03 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIAH3Q8IW03 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIAH3Q8IW03 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIAH3Q8IW03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIAH3Q8IW03 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIAH3Q8IW03 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIAH3Q8IW03 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIAH3Q8IW03 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIAH3Q8IW03 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIAH3Q8IW03 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms