Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASGRP3Q8IV61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASGRP3Q8IV61 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP3Q8IV61 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP3Q8IV61 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP3Q8IV61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP3Q8IV61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms