Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLD3Q8IV08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLD3Q8IV08 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLD3Q8IV08 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLD3Q8IV08 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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PLD3Q8IV08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
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PLD3Q8IV08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD3Q8IV08 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLD3Q8IV08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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