Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PPARGC1BQ86YN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PPARGC1BQ86YN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
PPARGC1BQ86YN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPARGC1BQ86YN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PPARGC1BQ86YN6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PPARGC1BQ86YN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PPARGC1BQ86YN6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PPARGC1BQ86YN6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms