Protein–RNA interactions for Protein: Q86YL7

PDPN, Podoplanin, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPNQ86YL7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPNQ86YL7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDPNQ86YL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPNQ86YL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDPNQ86YL7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPNQ86YL7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPNQ86YL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPNQ86YL7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms