Protein–RNA interactions for Protein: Q86VX2

COMMD7, COMM domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD7Q86VX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COMMD7Q86VX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD7Q86VX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD7Q86VX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COMMD7Q86VX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD7Q86VX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD7Q86VX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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