Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6BQ86SZ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms