Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPP1R42Q7Z4L9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP1R42Q7Z4L9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPP1R42Q7Z4L9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP1R42Q7Z4L9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPP1R42Q7Z4L9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPP1R42Q7Z4L9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPP1R42Q7Z4L9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPP1R42Q7Z4L9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP1R42Q7Z4L9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP1R42Q7Z4L9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP1R42Q7Z4L9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPP1R42Q7Z4L9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms