Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP1BQ7LBR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP1BQ7LBR1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP1BQ7LBR1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP1BQ7LBR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP1BQ7LBR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms