Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOUQ7L0Q8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOUQ7L0Q8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOUQ7L0Q8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOUQ7L0Q8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOUQ7L0Q8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms