Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 THBS1-204ENST00000484734 1291 ntTSL 59.14□□□□□ -0.953e-11■■■■■ 39.7
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SND1Q7KZF4 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 36.95□□□□□ -1.35e-21■■■■■ 39.6
SND1Q7KZF4 CTSH-204ENST00000527715 2138 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 39.5
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SND1Q7KZF4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 39.4
SND1Q7KZF4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 39.4
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SND1Q7KZF4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-9■■■■■ 39.4
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SND1Q7KZF4 TMED4-204ENST00000477639 1950 ntTSL 222.58■■□□□ 1.214e-9■■■■■ 39.2
SND1Q7KZF4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 39.2
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SND1Q7KZF4 TM9SF1-205ENST00000528010 904 ntTSL 216.11■□□□□ 0.172e-10■■■■■ 39
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SND1Q7KZF4 MPDU1-214ENST00000576066 491 ntTSL 38.91□□□□□ -0.982e-10■■■■■ 38.9
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SND1Q7KZF4 CALR-207ENST00000590325 781 ntTSL 214.85□□□□□ -0.036e-26■■■■■ 38.5
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SND1Q7KZF4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.038e-13■■■■■ 38.5
SND1Q7KZF4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 08e-13■■■■■ 38.5
SND1Q7KZF4 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.198e-13■■■■■ 38.5
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SND1Q7KZF4 GLA-204ENST00000479445 793 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 37.7
SND1Q7KZF4 GLA-205ENST00000480513 612 ntTSL 38.14□□□□□ -1.113e-10■■■■■ 37.7
SND1Q7KZF4 GLA-206ENST00000486121 723 ntTSL 35.85□□□□□ -1.473e-10■■■■■ 37.7
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SND1Q7KZF4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 37.4
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SND1Q7KZF4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 37.4
SND1Q7KZF4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 37.4
SND1Q7KZF4 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 37.4
SND1Q7KZF4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 37.4
SND1Q7KZF4 CALR-206ENST00000588454 776 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-21■■■■■ 37.3
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SND1Q7KZF4 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 513.02□□□□□ -0.334e-74■■■■■ 37.3
SND1Q7KZF4 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 212.19□□□□□ -0.464e-74■■■■■ 37.3
SND1Q7KZF4 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-74■■■■■ 37.3
SND1Q7KZF4 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.564e-74■■■■■ 37.3
SND1Q7KZF4 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-74■■■■■ 37.3
SND1Q7KZF4 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-74■■■■■ 37.3
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SND1Q7KZF4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-21■■■■■ 37.3
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SND1Q7KZF4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 13e-7■■■■■ 37
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