Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms