Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL3Q6P499 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPAL3Q6P499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPAL3Q6P499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPAL3Q6P499 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIPAL3Q6P499 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL3Q6P499 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms