Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF343Q6P1L6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF343Q6P1L6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF343Q6P1L6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF343Q6P1L6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF343Q6P1L6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms