Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRPF40BQ6NWY9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PRPF40BQ6NWY9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PRPF40BQ6NWY9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRPF40BQ6NWY9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRPF40BQ6NWY9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRPF40BQ6NWY9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms