Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV3

NIPAL1, Magnesium transporter NIPA3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL1Q6NVV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL1Q6NVV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPAL1Q6NVV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL1Q6NVV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL1Q6NVV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPAL1Q6NVV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPAL1Q6NVV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL1Q6NVV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL1Q6NVV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL1Q6NVV3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL1Q6NVV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL1Q6NVV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL1Q6NVV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL1Q6NVV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL1Q6NVV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL1Q6NVV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms