Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RETSATQ6NUM9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETSATQ6NUM9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RETSATQ6NUM9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RETSATQ6NUM9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RETSATQ6NUM9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms