Protein–RNA interactions for Protein: Q69YL0

NCBP2-AS2, Uncharacterized protein NCBP2-AS2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2-AS2Q69YL0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP2-AS2Q69YL0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP2-AS2Q69YL0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP2-AS2Q69YL0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP2-AS2Q69YL0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCBP2-AS2Q69YL0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCBP2-AS2Q69YL0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms