Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC39BQ5VTQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC39BQ5VTQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC39BQ5VTQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC39BQ5VTQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms