Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD3Q5T2D3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUD3Q5T2D3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD3Q5T2D3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD3Q5T2D3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD3Q5T2D3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD3Q5T2D3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD3Q5T2D3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms