Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1L2AQ5JQF8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1L2AQ5JQF8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1L2AQ5JQF8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1L2AQ5JQF8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms