Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GREB1Q4ZG55 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GREB1Q4ZG55 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GREB1Q4ZG55 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREB1Q4ZG55 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GREB1Q4ZG55 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms