Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.4□□□□□ -1.541e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.551e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.661e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.37□□□□□ -1.871e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.221e-30■■■■■ 53.4
LARP7Q4G0J3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.971e-30■■■■■ 53.4
LARP7Q4G0J3 AP000233.2-202ENST00000418942 684 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 52.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC7.35□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 52.8
LARP7Q4G0J3 AP000233.2-201ENST00000453802 577 ntTSL 35.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 52.8
LARP7Q4G0J3 NDNF-204ENST00000515757 564 ntTSL 414.93□□□□□ -0.029e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 NDNF-203ENST00000511408 560 ntTSL 414.06□□□□□ -0.169e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.11□□□□□ -1.279e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP65-201ENST00000410278 313 ntBASIC9.51□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.385e-8■■■■■ 51.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC7.85□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 51.2
LARP7Q4G0J3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.121e-16■■■■■ 51.1
LARP7Q4G0J3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 50.8
LARP7Q4G0J3 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 50.8
LARP7Q4G0J3 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 50.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 50.3
LARP7Q4G0J3 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 212.71□□□□□ -0.374e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 510.06□□□□□ -0.84e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.4□□□□□ -1.224e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.344e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.81□□□□□ -1.81e-47■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.931e-47■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 58.96□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-209ENST00000551570 399 ntTSL 37.75□□□□□ -1.173e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.2□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.993e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.05□□□□□ -0.642e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 48.6
LARP7Q4G0J3 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 519.33■□□□□ 0.686e-26■■■■■ 48
LARP7Q4G0J3 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 217.5■□□□□ 0.396e-26■■■■■ 48
LARP7Q4G0J3 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 211.71□□□□□ -0.536e-26■■■■■ 48
LARP7Q4G0J3 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 415.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 47
LARP7Q4G0J3 RN7SKP259-201ENST00000411066 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 45.2
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-208ENST00000551983 728 ntTSL 28.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 45.2
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt16.19■□□□□ 0.188e-59■■■■■ 44.6
LARP7Q4G0J3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.478e-59■■■■■ 44.6
LARP7Q4G0J3 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 522.17■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 217.76■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-206ENST00000475079 557 ntTSL 410.21□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC7.69□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 43.6
LARP7Q4G0J3 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-48■■■■■ 43.4
LARP7Q4G0J3 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP4-201ENST00000606815 322 ntBASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-202ENST00000358991 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.53□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-206ENST00000427594 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.091e-323■■■■■ 42.2
LARP7Q4G0J3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 213.61□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 211.42□□□□□ -0.582e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 41.1
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