Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.4□□□□□ -1.541e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.551e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.661e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.37□□□□□ -1.871e-30■■■■■ 53.9
LARP7Q4G0J3 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.221e-30■■■■■ 53.4
LARP7Q4G0J3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.971e-30■■■■■ 53.4
LARP7Q4G0J3 AP000233.2-202ENST00000418942 684 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 52.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC7.35□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 52.8
LARP7Q4G0J3 AP000233.2-201ENST00000453802 577 ntTSL 35.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 52.8
LARP7Q4G0J3 NDNF-204ENST00000515757 564 ntTSL 414.93□□□□□ -0.029e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 NDNF-203ENST00000511408 560 ntTSL 414.06□□□□□ -0.169e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.11□□□□□ -1.279e-8■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP65-201ENST00000410278 313 ntBASIC9.51□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 52.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.385e-8■■■■■ 51.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC7.85□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 51.2
LARP7Q4G0J3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.121e-16■■■■■ 51.1
LARP7Q4G0J3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 50.8
LARP7Q4G0J3 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 50.8
LARP7Q4G0J3 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 50.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 50.3
LARP7Q4G0J3 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 212.71□□□□□ -0.374e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 510.06□□□□□ -0.84e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.4□□□□□ -1.224e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.344e-26■■■■■ 49.8
LARP7Q4G0J3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.81□□□□□ -1.81e-47■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.931e-47■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 58.96□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 ATP5B-209ENST00000551570 399 ntTSL 37.75□□□□□ -1.173e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.2□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.993e-8■■■■■ 49.3
LARP7Q4G0J3 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.05□□□□□ -0.642e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-16■■■■■ 49.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 48.6
LARP7Q4G0J3 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 519.33■□□□□ 0.686e-26■■■■■ 48
LARP7Q4G0J3 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 217.5■□□□□ 0.396e-26■■■■■ 48
LARP7Q4G0J3 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 211.71□□□□□ -0.536e-26■■■■■ 48
LARP7Q4G0J3 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 415.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 47
LARP7Q4G0J3 RN7SKP259-201ENST00000411066 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 45.2
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-208ENST00000551983 728 ntTSL 28.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 45.2
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 44.9
LARP7Q4G0J3 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt16.19■□□□□ 0.188e-59■■■■■ 44.6
LARP7Q4G0J3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.478e-59■■■■■ 44.6
LARP7Q4G0J3 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 522.17■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 217.76■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-206ENST00000475079 557 ntTSL 410.21□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 44.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC7.69□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 43.6
LARP7Q4G0J3 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-48■■■■■ 43.4
LARP7Q4G0J3 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP4-201ENST00000606815 322 ntBASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-202ENST00000358991 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.53□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-206ENST00000427594 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 42.3
LARP7Q4G0J3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.091e-323■■■■■ 42.2
LARP7Q4G0J3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 213.61□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 211.42□□□□□ -0.582e-18■■■■■ 41.1
LARP7Q4G0J3 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 41.1
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