Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MINDY4Q4G0A6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MINDY4Q4G0A6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MINDY4Q4G0A6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MINDY4Q4G0A6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY4Q4G0A6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY4Q4G0A6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms