Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRY2Q49AN0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CRY2Q49AN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CRY2Q49AN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRY2Q49AN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRY2Q49AN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRY2Q49AN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRY2Q49AN0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CRY2Q49AN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CRY2Q49AN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRY2Q49AN0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRY2Q49AN0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRY2Q49AN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRY2Q49AN0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CRY2Q49AN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRY2Q49AN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRY2Q49AN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CRY2Q49AN0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms