Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED5Q49AG3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED5Q49AG3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED5Q49AG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED5Q49AG3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED5Q49AG3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms