Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NBPF8Q3BBV2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NBPF8Q3BBV2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NBPF8Q3BBV2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NBPF8Q3BBV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NBPF8Q3BBV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NBPF8Q3BBV2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NBPF8Q3BBV2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NBPF8Q3BBV2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms