Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDUFAF6Q330K2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF6Q330K2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF6Q330K2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF6Q330K2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFAF6Q330K2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms