Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWI5Q1ZZU3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWI5Q1ZZU3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWI5Q1ZZU3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SWI5Q1ZZU3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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