Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDK4Q16654 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDK4Q16654 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK4Q16654 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK4Q16654 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK4Q16654 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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