Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPE65Q16518 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPE65Q16518 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPE65Q16518 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPE65Q16518 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPE65Q16518 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPE65Q16518 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
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