Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNXAQ16473 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNXAQ16473 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNXAQ16473 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNXAQ16473 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNXAQ16473 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNXAQ16473 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNXAQ16473 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNXAQ16473 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNXAQ16473 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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TNXAQ16473 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TNXAQ16473 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNXAQ16473 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNXAQ16473 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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