Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GRK1Q15835 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRK1Q15835 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRK1Q15835 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRK1Q15835 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRK1Q15835 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRK1Q15835 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms