Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHD4Q14839 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHD4Q14839 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CHD4Q14839 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHD4Q14839 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHD4Q14839 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHD4Q14839 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHD4Q14839 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD4Q14839 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD4Q14839 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD4Q14839 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD4Q14839 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHD4Q14839 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHD4Q14839 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHD4Q14839 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHD4Q14839 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD4Q14839 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD4Q14839 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHD4Q14839 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
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