Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCD11Q14690 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCD11Q14690 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCD11Q14690 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDCD11Q14690 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDCD11Q14690 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDCD11Q14690 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDCD11Q14690 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDCD11Q14690 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCD11Q14690 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCD11Q14690 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
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