Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCARF1Q14162 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCARF1Q14162 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SCARF1Q14162 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCARF1Q14162 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCARF1Q14162 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCARF1Q14162 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
SCARF1Q14162 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCARF1Q14162 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
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