Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIDRQ14159 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPIDRQ14159 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIDRQ14159 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIDRQ14159 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIDRQ14159 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIDRQ14159 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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