Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIM29Q14134 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM29Q14134 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM29Q14134 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM29Q14134 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRIM29Q14134 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM29Q14134 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
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