Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCINQ13939 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCINQ13939 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCINQ13939 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCINQ13939 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCINQ13939 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCINQ13939 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCINQ13939 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCINQ13939 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCINQ13939 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCINQ13939 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCINQ13939 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCINQ13939 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCINQ13939 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCINQ13939 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCINQ13939 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCINQ13939 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCINQ13939 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCINQ13939 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCINQ13939 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCINQ13939 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCINQ13939 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCINQ13939 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCINQ13939 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCINQ13939 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCINQ13939 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCINQ13939 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCINQ13939 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCINQ13939 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCINQ13939 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCINQ13939 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCINQ13939 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCINQ13939 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCINQ13939 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCINQ13939 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCINQ13939 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCINQ13939 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCINQ13939 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCINQ13939 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCINQ13939 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCINQ13939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCINQ13939 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCINQ13939 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCINQ13939 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCINQ13939 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCINQ13939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCINQ13939 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCINQ13939 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCINQ13939 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCINQ13939 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCINQ13939 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCINQ13939 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCINQ13939 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCINQ13939 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCINQ13939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms