Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCINQ13939 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCINQ13939 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCINQ13939 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCINQ13939 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCINQ13939 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCINQ13939 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCINQ13939 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCINQ13939 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCINQ13939 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCINQ13939 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCINQ13939 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCINQ13939 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCINQ13939 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCINQ13939 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCINQ13939 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCINQ13939 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCINQ13939 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCINQ13939 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCINQ13939 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCINQ13939 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCINQ13939 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCINQ13939 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCINQ13939 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCINQ13939 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCINQ13939 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCINQ13939 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCINQ13939 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCINQ13939 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCINQ13939 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCINQ13939 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCINQ13939 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCINQ13939 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCINQ13939 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCINQ13939 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCINQ13939 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCINQ13939 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCINQ13939 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCINQ13939 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCINQ13939 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCINQ13939 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCINQ13939 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCINQ13939 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCINQ13939 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCINQ13939 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCINQ13939 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCINQ13939 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCINQ13939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCINQ13939 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCINQ13939 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCINQ13939 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCINQ13939 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCINQ13939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCINQ13939 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCINQ13939 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCINQ13939 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCINQ13939 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCINQ13939 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCINQ13939 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCINQ13939 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCINQ13939 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCINQ13939 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCINQ13939 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCINQ13939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
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