Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPBGQ13641 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPBGQ13641 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPBGQ13641 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGQ13641 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPBGQ13641 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPBGQ13641 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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